Юрий Антонович Якорь

Копировать ссылку

17.01.2013 | Суперкомпьютер и лекарства

Здравствуйте, меня очень интересует использование суперкомпьютеров в биологии. И мне интересно, как суперкомпьютер МГУ помогает в создании лекарств, и в частности Визомитина. К сожалению, не на сайте лекарства, не на сайтах МГУ этот вопрос не освящен. Поиск по научным базам данных и просто в интернете тоже мало результативен, по-видимому, я не там ищу. Подскажите, какие статьи в научных и научно-популярных журналах содержат полученные на суперкомьютере результаты связанные с Визомитином и описывают сам процесс использования суперкомпьютера МГУ в разработке этого и других лекарств.

Александр Владимирович Тихонравов

Директор Научно-исследовательского вычислительного центра

18.01.2013 | Ответ

Уважаемый Юрий Антонович! На Ваш вопрос отвечает доктор ф.-м. н., зав. лабораторией вычислительных систем и прикладных технологий программирования НИВЦ МГУ Владимир Борисович Сулимов:

Информация о разработке Визомитина есть, например, на сайте.

Основой разработки являются работы академика Владимира Петровича Скулачёва - декана факультета биоинженерии и биоинформатики МГУ.
В данной разработке суперкомпьютерное моделирование с использованием методов молекулярной динамики помогло понять механиз действия на организм активного вещества, которое входит в Визомитин. Детали этих исследований лучше всего получить напрямую от академика Скулачева.
Вот некоторые другие работы по разработке лекарств в МГУ на суперкомпьютерах:

1. Sinauridze EI, Romanov AN, Gribkova IV, Kondakova OA, Surov SS, et al. (2011) New Synthetic Thrombin Inhibitors: Molecular Design and Experimental Verification. PLoS ONE 6(5): e19969. doi:10.1371/journal.pone.0019969

2. Садовничий В.А., Сулимов В.Б. Суперкомпьютерные технологии в медицине // Суперкомпьютерные технологии в науке, образовании и промышленности. Под редакцией: академика В.А. Садовничего, академика Г.И. Савина, чл.-корр. РАН Вл.В. Воеводина. Издательство Московского Университета. 2009 г. С. 16-23.

3. В.А.Садовничий, В.Б.Сулимов, Е.В.Каткова, А.Н.Романов, А.В.Сулимов, И.В.Оферкин, Д.В.Стамбольский, В.А.Ткачук Молекулярное моделирование для разработки новых лекарств на основе ингибиторов урокиназы // «Постгеномные исследования и технологии» (под ред. чл.-корр. РАН С.Д.Варфоломеева). Изд-во Московского Университета. 2011. ISBN 978-5-317-03968-4. С.103-140.

4. Сулимов А.В., Втюрина Д.Н., Романов А.Н., Масленников Е.Д., Сулимов В.Б., Курочкин И.Н., Упоров И.В., Затейщиков Д.А., Носиков В.В., Варфоломеев С.Д. Экспертные системы персонифицированной медицины: применение байесовских сетей для предсказания состояния пациентов // № Пост-геномные исследования и технологии» (под ред. чл.-корр. РАН С.Д.Варфоломеева). Изд-во Московского Университета, 2011. ISBN 978-5-317-03968-4. С.641-702.

5. Кондакова О.А., Головачева А.Ю., Романов А.Н., Лайков Д.Н., Медведева Н.А., Медведев О.С., Головин А.В., Сулимов В.Б. Применение методов молекулярного моделирования для разработки новых ингибиторов эндотелин превращающего фермента // в монографии «Пост-геномные исследования и технологии» (под ред. чл.-корр. РАН С.Д.Варфоломеева). Изд-во Московского Университета. 2011. ISBN 978-5-317-03968-4. С.141-173.